La formation Hortimet considère les filières horticoles dans leur globalité, aux différentes échelles de temps et d'espace, et propose un projet personnel d'amélioration d'une filière pouvant inclure l'amélioration variétale, l'obtention des semences et plants, la production, le stockage et/ou la transformation, la distribution.
La spécialité Hortimet proprement dite (M2) comprend 9 unités d'enseignement (UE) et des activités continues (projet personnel) qui aboutissent à la soutenance d'une synthèse présentée devant un jury pluridisciplinaire. En début de M2 des conférences introductives présentent les enjeux du développement durable, dans le secteur agricole et des défis de l'innovation technique et organisationnelle dans ce contexte. La formation s'achève par le stage de fin d'études réalisé en organisation professionnelle, entreprise, ou unité de recherche, pour une durée de 5 à 6 mois (en France ou à l'étranger), et soutenu oralement devant un jury.